Уважая бритву Оккама, надо сразу сказать, что СК должны взаимно дополнять друг друга, а не дублировать. Это не обязательно, но желательно. Надо быть реалистами и верить в три зеленых свистка.

Так вот, о нитях (threads)и связывании записей можно сказать, что КС и нити не зависимы друг от друга (разнесены по плоскостям в идеальном случае), хотя и пересекаются. Это, кстати, удобно — записи одной нити могут иметь разные КС и, соответственно, разные спектры группировки на кучки.
Технологически поддержка threads разбивается на два этапа:
а) вставка записи в нить; производится аналогично КС (но плоскость имен не пересекается)
б) визуализация нити; вот тут можно извращаться различными методами: графически, на флеше с zoom, линками next/prev или методами «etc». На свой вкус.
Только не надо пытаться смешать в один клубок КС и thread — сами же и запутатесь.